Ο Γ.Σ. Μαρκό ιδρύθηκε το 1927 και το 1930 αναγνωρίστηκε επίσημα από το Πρωτοδικείο Αθηνών κατόπιν της υπ΄ αριθμόν 7839 απόφασης.^[5][6] Το 1961 αναγνωρίστηκε επίσημα από την Ε.Π.Ο. με Αριθμό Μητρώου 932 και εντάχθηκε στην Ε.Π.Σ. Αθηνών,^[7] ξεκινώντας την επίσημη αγωνιστική του δράση τη σεζόν 1961–62.

Το 1969 βρέθηκε για πρώτη φορά στο κορυφαίο πρωτάθλημα της Ε.Π.Σ. Αθηνών, όπου και αγωνίστηκε για πρώτη φορά από τη σεζόν 1969–70 μέχρι και τη σεζόν 1972–73. Το 1978 επιστρέφει εκ νέου στο κορυφαίο πρωτάθλημα της Α΄ Κατηγορίας Ε.Π.Σ. Αθηνών, όπου και από τη σεζόν 1978–79 καθιερώθηκε.

Το 1984 αναδείχθηκε υπερπρωταθλητής Ε.Π.Σ. Αθηνών και προβιβάστηκε στην Εθνική Ερασιτεχνική Κατηγορία, όπου και αγωνίστηκε τις χρονιές 1984–85, 1985–86 και 1986–87. Το 1994 αναδείχθηκε πρωταθλήτρια Ε.Π.Σ. Αθηνών και προβιβάστηκε στα εθνικά πρωταθλήματα, όπου καθιερώθηκε στα πρωταθλήματα της Δ΄ Εθνικής και της Γ΄ Εθνικής για περισσότερο από μια 15ετία και συγκεκριμένα μέχρι και το 2010.^[8]

Το 1995 κατέκτησε αμέσως το πρωτάθλημα της Δ΄ Εθνικής και προβιβάστηκε στην Γ΄ Εθνική όπου αγωνίστηκε από την περίοδο 1995–96 μέχρι και τη σεζόν 2004–05 με την επωνυμία «Ποδοσφαιρική Ανώνυμη Εταιρεία Γυμναστικός Σύλλογος Μαρκό Μαρκοπούλου» και με τον διακριτικό τίτλο «Π.Α.Ε. Μαρκό».^[9][10] Ακολούθως αγωνίστηκε στο πρωτάθλημα της Δ΄ Εθνικής από την περίοδο 2005–06 μέχρι και την περίοδο 2009–10, όπου υποβιβάστηκε στο τοπικό πρωτάθλημα της Ε.Π.Σ. Ανατολικής Αττικής έπειτα από 16 χρόνια παρουσίας στα εθνικά πρωταθλήματα της Γ΄ Εθνικής και της Δ΄ Εθνικής. Το 2019 κατέκτησε το πρωτάθλημα της Ε.Π.Σ. Ανατολικής Αττικής και κέρδισε την επάνοδο στα εθνικά πρωταθλήματα.

Το 1984 ήταν φιναλίστ του Κυπέλλου Ε.Π.Σ. Αθηνών και το 1994 αναδείχθηκε Κυπελλούχος, επικρατώντας στον τελικό έναντι του Α.Ο. Αγίου Ιεροθέου Περιστερίου. Επίσης, τις χρονιές 2006, 2007 και 2018 υπήρξε φιναλίστ του Κυπέλλου Ε.Π.Σ. Ανατολικής Αττικής.

Τη σεζόν 2019–20 τερμάτισε στη 2η θέση του 6ου Ομίλου της Γ΄ Εθνικής ως 4η κατηγορία πλέον. Τη σεζόν 2020–21 τερμάτισε στην 9η θέση του 6ου ομίλου και υποβιβάστηκε στα τοπικά πρωταθλήματα. Τη σεζόν 2021–22 κατέκτησε το πρωτάθλημα της Α΄ Κατηγορίας Ε.Π.Σ. Ανατολικής Αττικής και την 3η θέση στο Πρωτάθλημα Πρωταθλητριών Ε.Π.Σ. 2022 και κέρδισε την επιστροφή στην Γ΄ Εθνική Κατηγορία.

Η σεζόν 2024–25 είναι μια από τις πιο χρυσές της ομάδας, και αυτό διότι κατέκτησε την πρώτη θέση του 4ου ομίλου και την ιστορική άνοδο στην Σούπερ Λιγκ 2 (δεύτερη τη τάξει κατηγορία).^[11

ΜΕΛΗ Δ.Σ.

Προεδρος: Αντώνης Πικουλας

Διευθύνων Σύμβουλος: Μιχάλης Δαλαμάνης

Μέλη: Παναγιώτης Τσάλας

SLO I ΥΠΕΥΘΥΝΟΣ ΕΠΙΚΟΙΝΩΝΙΑΣ ΜΕ ΤΟΥΣ ΦΙΛΑΘΛΟΥΣ: ΠΑΝΑΓΙΩΤΗΣ ΤΣΑΛΑΣ ΤΗΛ: 6948-876345 Email: pantsalas@hotmail.com